2007 年-2009 年，环境保护部牵头，会同地方政府、国家发改委、水利部 共同组成领导小组，中国环境科学研究院作为项目技术负责单位，组织全国 40 多家优势单位组成项目组，选择对我国水环境安全和社会经济发展有决定性作用 的九大湖库（包括我国的 5 大淡水湖泊，太湖、巢湖、洞庭湖、鄱阳湖和洪泽湖、 污染严重的滇池和 3 大水库，三峡水库、丹江口水库和小浪底水库），开展了全 国重点湖泊水库生态安全调查与评估工作。本项目首次提出了适用于我国湖泊水库特点的生态安全理念，从最为基础的 数据收集和现场生态安全调查入手，以水华暴发和水源地水质安全为核心，兼顾 流域人类活动和水生态健康等方面，以流域社会经济发展模式和产业结构与湖泊 水库生态安全间的响应关系为主线，建立了“4+1”的湖泊生态安全评估方法和 技术体系，即在湖泊生态健康、生态服务功能、流域人类活动影响、生态灾变等 评估的基础上，进行生态安全综合评估。 2008 年，太湖、巢湖和滇池为不安全水平，其中太湖和滇池接近很不安全 水平；洞庭湖、鄱阳湖和洪泽湖为一般安全水平，已经接近不安全水平，而三峡 水库、丹江口水库和小浪底水库为安全水平。
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